Το Τμήμα Αγροτικής Ανάπτυξης και Τροφίμων:

• Σε συνεργασία με το αρμόδιο Υπουργείο για το σχεδιασμό της αγροτικής, δασικής και αλιευτικής πολιτικής, εισηγείται την επεξεργασία και τη λήψη μέτρων για την επίτευξη των αναπτυξιακών στόχων και την εξασφάλιση των αναγκαίων προϋποθέσεων για την υλοποίηση του παραπάνω σχεδιασμού με σκοπό την αξιοποίηση των δυνατοτήτων και των ιδιαιτεροτήτων της Μακεδονίας και της Θράκης.
• Σε συνεργασία με το Τμήμα Ευρωπαϊκών Υποθέσεων του Υπουργείου και το αντίστοιχο θεματικό Υπουργείο παρακολουθεί, εισηγείται και εκπονεί προγράμματα που χρηματοδοτούνται από την Ε. Ε και αφορούν την ανάπτυξη της αγροτικής πολιτικής.
• Ενισχύει την ίδρυση, οργάνωση και λειτουργία επιχειρήσεων με αντικείμενο την αγροτική, κτηνοτροφική παραγωγή, μεταποίηση και εμπορία.
• Μελετά και βοηθά στο προγραμματισμό των αλιευτικών δραστηριοτήτων στα υδάτινα οικοσυστήματα (εσωτερικά και θαλάσσια) με σκοπό την προστασία και τον έλεγχο της αύξησης των αλιευτικών προϊόντων σύμφωνα με τις εθνικές και ευρωπαϊκές προτεραιότητες.
• Στηρίζει και υποβοηθά τις προσπάθειες για την εξειδίκευση της γεωργίας και της κτηνοτροφίας. Υποστηρίζει και προωθεί την ποιοτική παραγωγή τροφίμων, την εναλλακτική γεωργία και την καλλιέργεια των βιολογικών προϊόντων.
• Συμμετέχει στην προσπάθεια για την προστασία της χλωρίδας και της πανίδας, αλλά και της βιοποικιλότητας και συμμετέχει στην εκπόνηση προγραμμάτων ενίσχυσης και εμπλουτισμού αυτών.
• Ενισχύει εκδηλώσεις και δράσεις για την προώθηση των αγροτικών προϊόντων.
• Συμμετέχει και υποβοηθά στην εκπόνηση μελετών για τη στήριξη και τον εκσυγχρονισμό των αγροτικών συνεταιριστικών οργανώσεων με κύριο στόχο την προώθηση πρότυπων συνεταιριστικών δραστηριοτήτων.
• Συλλέγει στοιχεία από τη Μακεδονία και τη Θράκη για την επισήμανση των βιοτόπων ιδιαίτερης σημασίας για τη διατήρηση των ειδών της άγριας πανίδας και χλωρίδας και ιδιαίτερα για τη μελέτη και απογραφή του φυτικού και θηραματικού κεφαλαίου της Βόρειας Ελλάδας, καθώς και για την παροχή οδηγιών για την προστασία και ανάπτυξη των πληθυσμών των θηραμάτων.
• Βοηθά στην εκπόνηση προγραμμάτων αντιπυρικής προστασίας των δασικών εκτάσεων στη Μακεδονία κα τη Θράκη, στο σχεδιασμό και στη μελέτη μεθόδων και μέσων για την πρόληψη των δασικών πυρκαγιών σε συνεργασία με συναρμόδιους φορείς. Παρακολουθεί την εφαρμογή των αναδασώσεων.
• Ενημερώνεται από το αρμόδιο Υπουργείο και τους αρμόδιους φορείς της Ε. Ε και τηρεί βάση δεδομένων με πληροφορίες που αφορούν την αγροτική πολιτική σε εθνικό επίπεδο και την Κοινή Αγροτική Πολιτική της Ε.Ε. Επιμελείται της διάθεσης πληροφοριακού υλικού στους πολίτες και φορείς της Βόρειας Ελλάδας.
• Σε συνεργασία με το Τμήμα Προώθησης της Συνεργασίας με τις Χώρες της Νότιο  Ανατολικής Ευρώπης, και με το Τμήμα Ευρωπαϊκών Υποθέσεων του Υπουργείου, εξασφαλίζει την ενημέρωση των χωρών της Νότιο Ανατολικής Ευρώπης για τη λειτουργία και τη νομοθεσία της Κοινής Αγροτικής Πολιτικής της Ευρωπαϊκής Ένωσης και συμβάλλει στην προώθηση των οικονομικών στόχων των χωρών αυτών μέσω της ένταξης των δραστηριοτήτων αυτών σε προγράμματα και πρωτοβουλίες της Ευρωπαϊκής Ένωσης, που παρέχουν χρηματική και τεχνική υποστήριξη.
• Προς εξυπηρέτηση των σκοπών του Τμήματος συνεργάζεται με τα συναρμόδια Υπουργεία, Οργανισμούς και τις υπηρεσίες των Περιφερειών της Μακεδονίας και της Θράκης, με σκοπό τον ενιαίο σχεδιασμό της πολιτικής και την ομοιόμορφη αντιμετώπιση των επί μέρους θεμάτων.