Το Τμήμα Μηχανοργάνωσης:

• Είναι αρμόδιο για την κάλυψη των μηχανογραφικών αναγκών του Υπουργείου από πλευράς ανάλυσης, σχεδίασης, προγραμματισμού, τεκμηρίωσης και υλοποίησης των ηλεκτρονικών προγραμμάτων και της ηλεκτρονικής διακυβέρνησης του Υπουργείου.
• Συντάσσει τις ειδικές τεχνικές μελέτες και μελέτες σκοπιμότητας του τομέα ευθύνης του.
• Παρέχει υπηρεσίες υποστήριξης για την κάλυψη αναγκών σε εξειδικευμένους τομείςτης πληροφορικής, όπως βάσεις πληροφοριών, επικοινωνία, διασύνδεση, υλικό και λογισμικό.
• Συμμετέχει, υποστηρίζει και οργανώνει την υλοποίηση, παρακολούθηση και καλή λειτουργία του" Ολοκληρωμένου Πληροφοριακού Συστήματος (ΟΠΣ) Παρακολούθησης της Ανάπτυξης" του Υπουργείου Μακεδονίας Θράκης.
• Έχει την επιμέλεια της καλής λειτουργίας, εκμετάλλευσης, συντήρησης και αναβάθμισης του εξοπλισμού και του λογισμικού, την προετοιμασία, εισαγωγή, αφαίρεση και έλεγχο δεδομένων και την ασφάλεια του συνόλου των ηλεκτρονικών συστημάτων, του λογισμικού και των δεδομένων.
• Λαμβάνει τις εισηγήσεις όλων των διευθύνσεων, τμημάτων και γραφείων, καταρτίζει βάσεις δεδομένων, επεξεργάζεται τα στοιχεία, διαμορφώνει τις σχετικές βάσεις δεδομένων δημιουργώντας τράπεζες πληροφοριών και ηλεκτρονική στατιστική βιβλιοθήκη. Ελέγχει την προσβασιμότητα στο σύνολο αυτών των πληροφοριών.
• Έχει την ευθύνη καλής λειτουργίας των δικτυακών κόμβων του στους οποίους συμμετέχει, συντονίζει ή εποπτεύει το Υπουργείο.
• Είναι υπεύθυνο για τη συντήρηση και καλή λειτουργία της ηλεκτρονικής ιστοσελίδας στο διαδίκτυο.