Το Τμήμα Ευρωπαϊκών Υποθέσεων:

• Προωθεί και υποστηρίζει την ανάπτυξη δεσμών με την Ευρωπαϊκή Ένωση και ενισχύει τις δράσεις και το έργο των Ευρωπαϊκών Οργάνων και Διεθνών Οργανισμών και των Μη Κυβερνητικών Οργανώσεων που εδρεύουν στη Βόρεια Ελλάδα.
• Στόχο του Τμήματος αποτελεί η απρόσκοπτη επικοινωνία και επαφή των πολιτών της Βόρειας Ελλάδας με τα όργανα της Ε. Ε. και η άμεση ενημέρωση για τις πολιτικές της Ε.Ε., ιδίως δε για την περιφερειακή ανάπτυξη.
• Παρακολουθεί στο πλαίσιο των αρμοδιοτήτων του τα προγράμματα και τις πολιτικές της Ε.Ε. στο χώρο ευθύνης του.
• Συμμετέχει στο σχεδιασμό, την κατάρτιση και την εκτέλεση δράσεων, που εμπίπτουν σε προγράμματα που χρηματοδοτούνται από την Ε.Ε.
• Συμμετέχει στην κατάρτιση και επεξεργασία ολοκληρωμένων προγραμμάτων περιφερειακής ανάπτυξης της Μακεδονίας και της Θράκης. Μέσω της διαδικτύωσης των Περιφερειών της Μακεδονίας και της Θράκης σε συνεργασία με το Τμήμα Οικονομίας και Ανάπτυξης του Υπουργείου προωθεί την ισόρροπη ανάπτυξη των Περιφερειών αυτών σε ευρωπαϊκό επίπεδο.
• Συντονίζει και εισηγείται τη συμμετοχή των Περιφερειών της Μακεδονίας και της Θράκης σε προγράμματα της Ε.Ε και παρακολουθεί την εξέλιξη τους.
• Προωθεί τα συμφέροντα των Περιφερειών, των Ο.Τ.Α και των λοιπών φορέων που δραστηριοποιούνται στη Μακεδονία και τη Θράκη στα αρμόδια όργανα της Ε.Ε. Παρακολουθεί τις εξελίξεις στο επίπεδο της περιφερειακής πολιτικής της Ε.Ε. και ενημερώνει τους αρμόδιους φορείς.
• Ενημερώνει τις αρμόδιες Υπηρεσίες και φορείς των χωρών της ΝΑ Ευρώπης για το νομικό και οικονομικό καθεστώς της Ευρωπαϊκής Ένωσης και διευκολύνει τις ευρωπαϊκές πρωτοβουλίες στις χώρες αυτές. Επιμελείται της συλλογής πληροφοριακού υλικού και φροντίζει για την καλύτερη ενημέρωση του πολίτη της Β. Ελλάδας.
• Μεριμνά για την τήρηση αρχείου τευχών της επίσημης Εφημερίδας Ε.Ε και λοιπών εντύπων και εκδόσεων της Ε.Ε. Ενημερώνει του πολίτες της Μακεδονίας και Θράκης για το ευρωπαϊκό κεκτημένο.
• Προς εξυπηρέτηση των σκοπών του Τμήματος συνεργάζεται με τα συναρμόδια Υπουργεία, Περιφέρειες, ΟΤΑ και Οργανισμούς, ιδίως δε, με τις αντίστοιχες μονά-δες του Υπουργείου Εξωτερικών, με σκοπό τον ενιαίο σχεδιασμό της πολιτικής και τη ν ομοιόμορφη αντιμετώπιση των επί μέρους θεμάτων.
• Επικουρεί όλα τα υπόλοιπα τμήματα και διευθύνσεις του Υπουργείου στο πλαίσιο των αρμοδιοτήτων τους σε θέματα σχετικά με την Ε.Ε τις δράσεις και τις πολιτικές της.